教育部出于全国学术不端公平性都会要求学位论文的学术不端的检测，市面上的查重软件一般用于高校对于硕士和博士论文采用的检测系统或是用户自己提前进行自查检测，目前查重软件主要有文思慧达、知网、Paperpass、论文狗免费查重、维普等等。下面以文思慧达为例：
1、检测文档格式的要求
论文狗免费查重系统对学位论文检测支持整篇上传，但文档格式对检测结果可能会造成影响，最终交稿格式按规范提交检测，可以将影响降到最小。系统的算法比较复杂，每次修改论文后再测可能会有第一次没测出的小段抄袭（该小段不会超过200 字，并且二次修改后论文一般会大大降低抄袭率） 。
2、检测对比库的问题
目前所公布的对比库包括：学术期刊总库，学位（博士，硕士，学士）论文全文数据库，会议论文全文数据库，报纸全文数据库，图书全文数据库，专利全文数据库，博客全文数据库，网络文档数据库，互联网文献数据库，英文数据库，年鉴数据库，标准库，用户共享库等，一些个人比对库和部分书籍不在百度学术论文助手的查重比对库中，所以，来源于这些的文献，是检测不出抄袭的。论文狗免费查重系统是目前市场上很成熟，检测速度很快，结果很准的一套检测系统。
3、关于分段和分章出结果的问题
上传论文后，系统会自动检测该论文的章节信息，如果学校的目录设置符合论文狗免费查重系统内置的分章判断条件，系统就会按章检测，分章出结果，否则会分段出结果。关于分段或分章主要涉及的阀值。建议，无论是分章还是分段，保持和学校一致即可。
4、关于引用的内容如何检测出来的问题
引用了别人的段落或句子，没有检测出来，引用标注了出处，算抄袭。”首先，引用算不算抄袭，与标注出处没有任何关系，引用能不能检测出来，与系统准不准确也没有关系。所有这些都靠系统的阀值来决定。查重系统对该套检测系统的灵敏度设置了一个阀值。以通常阀值设置3%为例，以段落（或章节）的字数来计算，单篇文献低于3%的抄袭或引用是检测不出来的，这种情况常见于大段文字中的小句或者小概念。举个例子：假如检测段落1（第一章）有10000 字，那么引用A 文献300字（10000 乘以3%=300）以内，是不会被检测出来的。若引用B文献超过300字，那么B文献分布于第一章中的抄袭都会被红字标注，不管位于第一章何处，即使打断成句子，只要超过20字就会被标注。
所以，通常一篇文章的引用，尽可能多的选择多篇文献，一篇截取几句，这样是不易被检测出来的。
但关于一些引用的为什么也算抄袭，还是因为前面阀值问题，高于设置阀值的标准就会统一算抄袭，一旦超标，即使标注了引用也无济于事。举例说明：某篇论文第一章有5000 字，那么第一章中，就只能引用A文献150 字以下，否则会被系统认为是抄袭。第二章4000 字，那么只能引用A 文献120字以下，否则会被系统认为是抄袭。第三章8000 字，第四章7000 字，分别为240 字以下和210 字以下，以此类推。综上所述，引用超标的计算方式是按章计算，这与抄袭的计算方式是一样的。
5、关于系统是怎么计算抄袭的问题
一篇论文的抄袭被检测出来的条件是13或20个字符单位以上的相似或抄袭都会被红字标注。
6、抄袭的修改方式
针对标红文字的修改方式除了第4点里面中提到的外，还有改词、换句、改变描述方式（变原句为倒装句、被动句、主动句等）、打乱段落顺序、删除关键词汇、关键句等。使用以上方法结合，可有效降低复制比，保证顺利通过。总体来说，需要在保证修改后句子通顺的前提下，尽量和原句在字面上保持不同。